近未来的日本，**颁布了名为《媒体良化法》的法令。其目标在于约束管理媒体扰乱社会风纪的不良行为，并允许特殊机关对违反该法的媒体诉诸武力。但是在过去的这些岁月里，仍然有许多勇敢的人为了言论自由奔走呼告，从而献出自己的生命。而旨在保护被“良化法”定为有害读物的书籍、保障百姓阅读自由的图书馆自卫组织图书队正是其中的佼佼者。历经严苛的训练和考验，年轻女孩笠原郁（荣仓奈奈 饰）正式成为图书队的一员。高中时代，郁曾遭到媒体良化队员的粗暴对待。关键时刻，一名日后被郁称为“王子殿下”的图书队员帮她解围，这一事件成为她加入图书队的重要原因。
军衔为二等图书正的堂上笃（冈田准一 饰）担任新队员的教官，他作风干练，行事严厉，同时还拥有迷人的气质。经过一番艰苦磨练，表现出众的郁光荣成为令所有队员都憧憬万分的图书特殊部队的成员，并分在了堂上教官的麾下。在堂上班长、副班长小牧干久（田中圭 饰）、一等图书士手冢光（福士苍汰 饰）和业务部图书馆员柴崎麻子（栗山千明 饰）的环绕之下，郁不断积累学习图书馆业务以及相关的专业知识。残酷的战争洗礼让郁和堂上班长的信任不断加深，而她也终于发现了堂上就是“王子殿下”这个事实。
这一日，图书队接到一项重要的任务，那就是担任《图书法规要览》的安保工作。这本书即将在“艺术祭典”上展出，目前世界范围内仅有一本幸存，作为自由的象征其无形价值弥足珍贵，此外更是图书队存在的根本经典。因此，图书队为了这本书煞费苦心，安保级别前所未有。与之相对，良化队则磨刀霍霍，试图对图书队以及“违禁书籍”予以致命一击。而在这一过程中，手冢光的哥哥——效力于文部科学省手冢慧（松坂桃李 饰）则为他的“未来计划”精心布下了险恶狡猾的陷阱，耐心等待猎物上钩。凭借一腔热血为了自由而战的图书队，他们的命运将何去何从？
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